Struktur dan Fungsi Virus
Virus adalah parasit intraseluler yang sangat kecil dan wajib, terdiri dari genom DNA atau RNA yang dikelilingi oleh lapisan protein pelindung yang dikode oleh virus itu sendiri. Virus dapat dianggap sebagai elemen genetik bergerak, kemungkinan berasal dari seluler, dan telah berevolusi lama bersama dengan inangnya. Dalam perkembangbiakan, virus sepenuhnya bergantung pada sel inang khusus yang menyediakan mesin metabolisme dan biosintetik untuk replikasi.
Virus lengkap disebut virion, dan fungsi utamanya adalah untuk mengirimkan genomnya ke dalam sel inang agar genom tersebut dapat diekspresikan melalui transkripsi dan translasi oleh sel inang. Genom virus, biasanya bersama dengan protein dasar, dikemas dalam kapsid protein simetris. Pada virus yang memiliki selubung (enveloped viruses), nukleokapsid dikelilingi oleh lapisan lipid dari membran sel inang yang dimodifikasi, yang dilapisi oleh glikoprotein spesifik virus.
Klasifikasi Virus Berdasarkan Morfologi dan Komposisi Kimia
Virus diklasifikasikan berdasarkan morfologi, komposisi kimia, struktur genom, dan cara replikasinya. Dalam hal morfologi, terdapat dua tipe utama bentuk kapsid: simetri heliks dan icosahedral. Pada virus dengan simetri heliks, kapsid tersusun dalam array heliks yang mengelilingi asam nukleat. Sementara itu, pada virus dengan simetri icosahedral, kapsid berbentuk polihedral dengan 20 permukaan segitiga sama sisi dan 12 puncak, yang membentuk kapsid simetris di sekitar inti genom virus.
Secara kimia, virus memiliki genom yang dapat terdiri dari DNA atau RNA, yang mungkin untai tunggal (ss) atau ganda (ds), serta bisa berbentuk linier atau sirkuler. Genom bisa berbentuk monopartit (satu molekul asam nukleat) atau multipartit (beberapa segmen asam nukleat). Jenis genom ini menentukan strategi replikasi yang berbeda, di mana beberapa genom RNA dapat langsung bertindak sebagai mRNA, sementara genom RNA lainnya memerlukan sintesis untai pelengkap untuk berfungsi.
Nomenklatur Virus
Nomenklatur virus tidak hanya didasarkan pada data fisik, tetapi juga pada struktur genom dan metode replikasi. Genom RNA untai tunggal virus dapat disebut positif jika bisa berfungsi sebagai mRNA atau negatif jika memerlukan sintesis untai pelengkap untuk bertindak sebagai mRNA. Selain itu, proses klasifikasi mempertimbangkan lokasi perakitan kapsid dan, pada virus berselubung, lokasi envelopment.
Dalam klasifikasi modern, nama keluarga virus biasanya berakhir dengan -viridae dan genus dengan -virus. Selain faktor fisik, konfigurasi asam nukleat (linier atau sirkuler, untai tunggal atau ganda), serta lokasi perakitan kapsid dan envelopment nukleokapsid, juga diperhatikan.
Struktur Inti Virus
Pada virus dengan nukleokapsid heliks, protein penyusun kapsid (protomers) tersusun mengelilingi asam nukleat mengikuti pola spiral. Pada virus icosahedral, protomers dikelompokkan dalam kapsomer oligomerik yang membentuk cangkang kapsid tertutup. Beberapa virus memiliki tambahan lapisan yang disebut selubung atau envelope, yang biasanya diambil dari membran sel inang yang telah dimodifikasi dan mengandung protein virus spesifik.
Protein glikosilasi pada selubung sangat penting dalam menentukan jangkauan inang dan komposisi antigenik virion. Virus berselubung juga mengandung protein inang tertentu sebagai komponen integral, yang berperan dalam perlindungan tambahan. Virus dengan struktur yang lebih kompleks dapat memiliki simetri heliks dan isometris pada komponen struktural yang berbeda, seperti yang terlihat pada beberapa virus besar.
Genom dan Mode Replikasi
Genom RNA virus memiliki variasi besar dalam struktur genomnya. Virus RNA dapat menunjukkan tingkat mutasi yang lebih tinggi dibandingkan virus DNA, menghasilkan adaptasi yang cepat terhadap inang baru. Beberapa virus RNA memiliki genom segmen, sementara yang lain memiliki genom yang utuh.
Genom DNA pada sebagian besar virus terdiri dari untai ganda linier. Namun, virus seperti papovavirus memiliki genom DNA sirkular. Beberapa virus, seperti parvovirus, memiliki DNA untai tunggal. Ada pula retrovirus yang memiliki genom RNA positif yang ditranskripsi balik menjadi DNA oleh enzim reverse transcriptase, memungkinkan integrasi ke dalam genom inang.
Kesimpulan
Virus adalah entitas unik yang, meskipun tidak hidup, mampu menyebabkan berbagai penyakit dengan memasuki dan mengendalikan sel inang. Klasifikasi virus melibatkan analisis morfologi, komposisi kimia, struktur genom, dan mode replikasi. Pemahaman tentang struktur dan fungsi virus penting untuk pengembangan terapi dan vaksin yang efektif. Virus memiliki kemampuan untuk berubah dan beradaptasi dengan cepat, yang menjadikannya tantangan khusus dalam bidang virologi dan kedokteran.