PATOGENESIS BAKTERI

Tropisme jaringan: bakteri tertentu memiliki preferensi terhadap jaringan tertentu
Spesifisitas spesies: bakteri patogen tertentu menginfeksi hanya spesies tertentu
Spesifisitas genetik dalam spesies: strains tertentu dalam suatu spesies secara genetik imun terhadap patogen

Postulat Koch

• Mikroorganisme yang diduga patogen harus ada di semua kasus penyakit dan tidak ada di hewan yang sehat 
• Mikroorganisme tersebut harus dapat diisolasi dari hewan yang sakit dan ditumbuhkan sebagai biakan murni 
• Sel-sel dari biakan murni mikroorganisme tersebut harus dapat menyebabkan penyakit di hewan yang sehat 
• Mikroorganisme tersebut harus dapat diisolasi kembali dan sama dengan mikroorganisme awal 

Beberapa spesifikasi perlekatan:

• contoh: Streptococcus mutants banyak ditemukan dalam plak gigi tetapi tidak di permukaan epitel lidah. Sebaliknya S. salivarius banyak melekat di sel epitel lidah tetapi tidak di plak gigi 
• contoh: Neisseria gonorrhoea menginfeksi manusia; E. coli K-88 menginfeksi babi 
• contoh: babi (varietas) tertentu tidak mudah terinfeksi E. coli K-88 

Proses Infeksi:

Sering dimulai dari bagian membran mukosa yang tersusun atas satu atau beberapa lapisan sel-sel epitel dan berhubungan dengan lingkungan luar.  Membran ini ada di berbagai bagian tubuh seperti saluran urogenital, respirasi dan gastrointestinal. Membran mukosa sering diselubungi lapisan pelindung yang merupakan glikoprotein, disebut mucus. 

PERLEKATAN (ADHERENCE)

Tahap-tahap perlekatan

•  Perlekatan nonspesifik/reversible
•  Perlekatan spesifik/permanen
• Biasanya perlekatan reversible mendahului perlekatan permanen tetapi pada beberapa kasus terjadi sebaliknya atau perlekatan spesifik tak akan pernah terjadi.

Perlekatan terjadi oleh 2 faktor: ligand & reseptor

• Ligand bakteri (adhesin): makromolekul yang merupakan komponen dari permukaan sel bakteri yang berinteraksi dengan reseptor di sel inang. Adhesin dapat berupa: komponen dari kapsula, dinding sel, pili atau fimbriae 
• Kapsula: lapisan yang berada di permukaan sel bakteri,berupa polisakarida (jarang berupa protein) dan merupakan matriks yang tersusun rapat
• Pili dan fimbriae: struktur berfilamen tersusun atas protein, berada di permukaan sel bakteri.

    Perbedaan pili dan fimbriae belum ada konsensus. Beberapa pendapat:

• Fimbriae dikode gen-gen yang terletak di kromosom, pili dikode oleh gen-gen di plasmid. Fimbriae lebih pendek, jumlahnya banyak di tiap sel, fungsi untuk perlekatan
• Pili lebih panjang, jumlah 1 atau beberapa di tiap sel, ada yang berfungsi untuk perlekatan, ada yang berfungsi untuk transfer gen (konjugasi)

Reseptor: makromolekul di permukaan sel eukaryotik sebagai tempat mengikat  ligand/adhesin spesifik (komplemen ligand). Reseptor biasanya berupa residu karbohidrat atau peptida.

ADESHIN

Adhesin yang umum pada E. coli: fimbriae. Galur (strain) tunggal E. coli dapat mengekspresikan lebih dari satu tipe fimbriae yang dikode oleh bagian-bagian yang berbeda dari kromosom  Keragaman genetik ini memungkinkan organisme beradaptasi terhadap perubahan lingkungan dan memperluas kesempatan untuk tumbuh di permukaan yang berbeda-beda dari inangnya. Banyak tipe fimbriae adhesif E. coli kemungkinan merupakan perkembangan dari fimbriae asal yang mirip dengan fimbriae tipe 1 dan tipe 4. Fimbriae tipe 1 pada E. coli memungkinkannya dapat mengikat D-manosa di permukaan sel eukaryotik. Sisi pengikatan pada fimbriae terletak di protein minor (28-31 kDa)  di ujung atau menyisip sepanjang fimbriae.

Dengan keanekaragaman genetik protein adhesin ini, bakteri dapat melekat ke berbagai reseptor. Pseudomonas, Vibrio dan Neisseria memiliki pili tipe IV yang mengandung subunit protein dengan asam amino (sering fenilalanin) termetilasi, di atau dekat ujung amino. Pili N-metilfenilalanin merupakan penentu virulensi dalam patogenesis infeksi paru oleh Pseudomonas aeruginosa pada penderita cystic fibrosis.

Beberapa spesifikasi perlekatan:

• Tropisme jaringan: bakteri tertentu memiliki preferensi terhadap jaringan tertentu. contoh: Streptococcus mutants banyak ditemukan dalam plak gigi tetapi tidak di permukaan epitel lidah. Sebaliknya S. salivarius banyak melekat di sel epitel lidah tetapi tidak di plak gigi
• Spesifisitas spesies: bakteri patogen tertentu menginfeksi hanya spesies tertentu. contoh: Neisseria gonorrhoea menginfeksi manusia; E. coli K-88 menginfeksi babi
• Spesifisitas genetik dalam spesies: strains tertentu dalam suatu spesies secara genetik imun terhadap patogen. contoh: babi (varietas) tertentu tidak mudah terinfeksi E. coli K-88

INVASI

•  beberapa bakteri patogen bertempat tinggal di permukaan epitel
•  beberapa spesies dapat menembus barrier sel epitel tetapi tetap di tempat kedatangannya
•  beberapa yang lain mengikuti aliran darah dan masuk sistem lain 

Contoh:

Shigella melakukan penetrasi dengan cara mengaktifkan sel-sel epitel usus menjadi bersifat endositik. Shigella biasanya tidak menyebar melalui aliran darah

Salmonella typhi menembus sel epitel masuk aliran darah

Jika pertumbuhan bakteri menyebar luas, sebagian akan masuk ke aliran darah dalam jumlah besar, kondisi ini disebut bakteremia

VIRULENSI: INVASIVENESS DAN TOKSISITAS

• Virulensi: kemampuan relatif patogen menyebabkan  penyakit/kerusakan pada inang, ditentukan oleh adanya invasiveness dan toksisitas
• Invasiveness: kemampuan patogen tumbuh dalam jaringan inang dalam jumlah banyak dan menghambat fungsi inang  (memiliki kemampuan melawan pertahanan tubuh inang)
• Toksisitas: kemampuan patogen menyebabkan penyakit dengan menghasilkan toksin yang menghambat fungsi  inang atau membunuh inang

Invasiveness

• Invasi patogen ke inang didukung oleh adanya produksi substansi ekstraseluler yang disebut invasin
• Invasin pada umumnya berupa protein (enzim) yang bersifat menyerang sel inang secara lokal dan atau memacu pertumbuhan dan penyebaran patogen
• Invasin mirip eksotoksin tetapi eksotoksin lebih mematikan dan spesifik

Invasin

Spreading factor

Merupakan enzim bakteri yang mempengaruhi secara fisik matriks jaringan dan ruang antar sel, membantu penyebaran patogen

Hialuronidase: dihasilkan oleh streptococci, staphylocci dan clostridia. Enzim ini menyerang interstitial cement dari jaringan konektif dengan depolimerisasi asam hialuronat.

Kolagenase: dihasilkan oleh Clostridium histolyticum dan Clostridium perfringens. Merusak kolagen penyusun otot

Neurominidase: dihasilkan oleh patogen usus seperti Vibrio cholerae dan Shigella dysentriae. Enzim ini mendegradasi asam neuraminik (= asam sialik) yang merupakan intercellular cement dari sel epitel mukosa intestinal

Streptokinase yang dihasilkan oleh streptococci dan staphylokinase yang dihasilkan oleh staphylococci. Kinase mengubah plasminogen yang bersifat inaktif menjadi plasmin yang merusak fibrin di darah dan mencegah pembekuan darah sehingga bakteri lebih mudah berdifusi

Read More

Parenkim

Merupakan sebuah jaringan yg tdr dr sel-sel hidup, sgt bervariasi scr morfologi maupun fisiologi dan biasanya mmlk btk polihedral, mmlk protoplas hidup. Sel-sel parenkim dpt dijumpai sebagai kelompok sel sejenis pendukung jaringan maupun berasosiasi dg jenis sel lainnya. Jaringan parenkim penyusun organ primer tumbuhan (mesofil daun, kortek dan empulur, bagian-bagian bunga) berdiferensiasi dr meristem dasar. Sel parenkim yg tergabung jar pengangkut primer dan sekunder dibentuk dari prokambium dan vaskular kambium. Parenkim jg dpt berkembang dr felogen dg mbtk feloderm, dmn jumlahnya meningkat dg adanya pertumbuhan sekunder

Isi sel parenkim merefleksikan aktifitas selnya. Pada jaringan yg aktif melakukan fotsin biasanya ditandai dg djumpainya byk kloroplas (=klorenkim). Ciri sel yg aktif berfungsi dlm proses fotosintesis adl memiliki banyak vakuola dan jaringannya mmlk ruang antar sel yg besar. Sedangkan sel parenkim sekretori biasanya memiliki protoplas padat. Sel parenkim dpt pula mengakumulasi berbagai jenis senyawa kimia. Pd biji, sel-sel parenkim penyimpan penyusun endosperm dicirikan dg adanya protein ataupun badan-badan minyak. Sel-sel parenkim penyimpan tepung dijumpai pd tuber kentang . Sel parenkim dpt pula terspesialisasi sbg jar penyimpan air, misalnya pd tumbuhan sukulen yi Agave, Aloe, Sansevieria, Peperomia. Sel-sel tsb biasanya berukuran besar, berdinding tipis, tssn dlm btk barisan, memanjang spt sel palisade, sitoplasmanya padat dg vakuola yg besar mengandung air ataupun substansi berlendir. Unt organ-organ penyimpan yg berada di dlm tnh, biasanya selnya tdk mengandung air, tp mengandung tepung, dpt pula kombinasi diantara keduanya. Dd sel parenkim dpt tebal maupun tipis. Bbrp sel parenkim dpt berdinding tbl maupun tipis.

Read More

Epidermis dan derivatnya

Merupakan lapisan sel terluar yang menyelubungi seluruh bagian tubuh tumbuhan primer, meliputi akar, batang, daun, bunga, buah, dan biji. Sel-sel inisial epidermis sebagian dpt berkembang mjd alat-alat tambahan lain sering dsbt derivat epidermis spt stoma, trikoma, sel kipas, sistolit, sel silika, dan sel gabus

Karakteristik sel epidermis
Memiliki bentuk yang bervariasi tetapi biasanya berbentuk tabular, dengan kedalaman (tinggi) yang rendah, kecuali pada beberapa lapisan biji yang sel epidermisnya mirip dengan sel palisade karena ketinggiannya lebih besar drpd lebarnya. Memiliki protoplast yang hidup, dan dapat menyimpan beberapa produk metabolisme. Memiliki plastida yg hy mengembangkan sedikit grana shg biasanya kekurangan klorofil. Epidermis tumbuhan yg hidup dlm naungan dan unt bbrp tumbhn yg hdp dlm air biasanya memiliki kloroplas yg aktif berfotsin. Kristal protein dan tepung dapat ditemukan dlm plastida pd epidermis. 

Sedangkan antosianin dijumpai dlm vakuola. Biasanya tersusun dari satu lapisan sel rapat tanpa ruang antar sel. Shg dikenal adanya istilah teichode unt merujuk pd ektodesmata dan saluran kecil tsb. Berfungsi dlm penyerapan daun dan ekskresi,bertujuan unt membatasi pergerakan air, tmsk aliran transpirasi dan solut
-Plasma sel melekat pada dinding sel sebagai selaput dengan sebuah vakuola besar di pusat yang berisi cairan sel
1.Amfistomatik
2.Hipostomatik
3.Epistomatik

Monokotil :
Sel penutup bentuk halter, ramping di tengah dan menggelembung
diujungnya
Inti memanjang di sepanjang sel penutup
Sel penutup bentuk halter, ramping di tengah dan menggelembung
diujungnya Inti memanjang di sepanjang sel penutup

Gymnospermae dan dikotil
Sel penutup bentuk ginjal

Gymnospermae dan dikotil
Sel penutup bentuk ginjal
Sel penutup bentuk ginjal

•Tipe anisositik/Cruciferae
bilamana sel penutup dikelilingi oleh 3 sel tetangga yg tdk sama besar
pada Cruciferae dan Solanaceae
bilamana sel penutup dikelilingi oleh 3 sel tetangga yg tdk sama besar
pada Cruciferae dan Solanaceae

•Tipe aktinositik
stomata dikelilingi oleh sel tetangga yg tersusun radier
stomata dikelilingi oleh sel tetangga yg tersusun radier

Sel epidermis memiliki ketebalan yg bervariasi. Bagian dinding luar periklinal biasanya lbh tebal dibanding bag dinding periklinal dlm dan antiklinalnya. Epidermis dg dinding yg sgt tebal dijumpai pd Conifer, dinding tsb mengalami lignifikasi dan hampir memenuhi lumennya. Noktah berhalaman primer dan plasmodesmata biasanya dijumpai pd dd antiklinal dan periklinal dlm dr sel epidermis. Dulunya plasmodesmata diperkirakan berada pd dd terluar epidermis dan dsbt sbg ektodesmata

Penelitian-penelitian terakhir menyebutkan bhw yg berada di permukaan luar dd epidermis bukanlah untaian sitoplasma akan tetapi mrpk berkas ruang interfibriler dlm dd selulosa yg terbentang dr plasma membran mnj

kutikula
Saluran kecil tsb (microchannel) pd tumb Xerofit biasanya mengandung pektin. Di lapisan terluar epidermis terkadang dijumpai adanya lapisan kutikula. Tersusun atas 2 lipid:

1. Kutin (tdk dpt larut) mrpk matrik dr kutikula
2. Lilin (wax), dpt larut, dideposisikan pd permukaan kutikula (epicuticular wax) maupun di bag dlm matrik (kutikula atau intracuticular wax

Kutikula mrpk karakteristik dr seluruh permukaan tumbuhan yg berhadapan dg udara luar. Pd kondisi tertentu dijumpai adanya kutikula pd sel-sel kortek, yg berfungsi sbg jaringan pelindung dsbt cuticular epitelium. Proses terbentuknya cuticular proper (kutin) dsbt cuticularization, yg dipermukaannya dijumpai adanya lilin (cuticular wax) tnp selulosa . Cuticular layer dijumpai dibawah kutin dan merupakan lapisan terluar dinding sel yang mengeras dg adanya kutin dg bbg tingkatan kekerasan. Proses terbentuknya cuticular layer dsbt cutinization. Pd bbrp spesies, inisial kutikula dsbt prokutikula (amorf). Kemudian penampakan ultrastrukturnya berubah mjd kutin yg khusus unt stp spesies. Kemunculan kutin diikuti dg tbtknya lapisan kutikula, makin lama makin menebal shg ketebalannya melebihi sel inisialnya. Kutin dan wax disintesis di sel epidermis dan harus bermigrasi ke permukaan dinding sel. Beberapa peneliti berpendapat bhw teichode berfungsi sbg jalur lewatnya kutin dan wax melewati dinding. Prekusor epicuticular wax diproduksi di RE dan di modifikasi di apparatus golgi sblm dilepaskan dr sitoplasma mll eksositosis

Stomata
Merupakan lubang/celah pd epidermis organ tumbuhan yg berwarna hijau yg dibatasi oleh sel khusus dsbt sel penutup. Sel penutup dibatasi oleh sel-sel yg btknya sama atau berbeda dg sel epidermis lainnya dan dsbt sel tetangga. Sel tetangga berperan dlm perubahan osmotik yg menyebabkan gerakan sel penutup yg mengatur lebar celah. Stomata dpt dijumpai pd bagi organ primer tanaman yg berada diatas permukaan tanah, terutama pd bag daun

Perkecualian

1. Tdk djumpai pd bag yg berada di ats perm tnh dr bbrp tnmn daratan yg tdk mmlk klorofil: Monotropa, Neotia 
2. Daun dr holoparasit famili Balanophoraceae : sgt kekurangan stomata
3. Stomata dpt ditemukan pd akar seedling Helianthus annuus, Pisum arvense, Ornithopus sativus, Pisum sativum, Ceratonia siliqua
4. Densitas stomata sgt bervariasi pd daun yg aktif melakukan fotsin, baik pd daun yg sama maupun pd daun berbeda namun msh dlm satu tanaman
5. Variasi tsb sgt dipengaruhi oleh faktor lingkungan, seperti cahaya dan kadar CO2

Daun dibedakan mjd 3 bdsrkn ltk stomatanya:
Berdasarkan letak sel penutup thd epidermis, dikenal 3 tipe stomata
Panerofor, Bila sel penutup terletak sama tingginya dg epidermis
Kriptofor, Bila sel penutup lebih rendah dr sel epidermis. 

Bila dilihat dari atas, sel penutup pd dikotil berbentuk ginjal, sedangkan pd Poaceae berbentuk halter

Distribusi stoma
Pada semua bagian tanaman di atas tanah, tidak ada di akar. Pada tanaman dikotil -> tersebar ; monokotil -> tersusun paralel. Pada daun jumlahnya ribuan - ratusan ribu per cm2. Pada tanaman air -> ada di permukaan atas daun (pada epidermis atas)

Sifat stoma : tertutup --> tidak ada cahaya ; terbuka --> ada cahaya

Penggolongan stomata pd tumbuhan dikotil yg bdsrkn letak sel tetangga disamping sel penutup stomatanya

Tipe anomositik/Ranunculaceae
Bilamana sel penutup dikelilingi oleh sel tetangga yg bentuk dan ukurannya sama dengan sel yg ada disekelilingnya
Pd Ranunculaceae, Caparidaceae, Cucurbitaceae, Malvaceae

Tipe parasitik/Rubiaceae
Bilamana sel penutup diiringi oleh sebuah sel tetangga atau lebih dg sb panjang sel tetangga sejajar dg sb sel penutup
Pada Rubiaceae, Magnoliaceae, Mimosaceae

Tipe diasitik/Caryophyllaceae
Stoma dikelilingi 2 sel tetangga, dinding kedua sel tetangga tsb tegak lurus thd sb panjang sel penutup serta celah
Pd Caryophyllaceae dan Acanthaceae

Tipe siklositik
Stomata dikelilingi oleh satu atau dua susunan sel tetangga yg tersusun msg-msg oleh 4 sel atau lb, mbtk lingkaran dg jari-jari yg sempit

Trikoma
A growth of hairs. Dpt dijumpai di seluruh bag tumbhn, dpt bertahan di sepanjang kehidupan tumbuhan ataupun gugur
Fungsi trikoma (5)
Tumbuhan yg hdp di daerah kering, daunnya memiliki banyak trikoma unt mengurangi penguapan (meningkatkan refleksi sinar matahari shg dpt menurunkan suhu daun)
Pd bbrp tumbhn epifit (Ex: Bromelia), trikoma pd daunnya dgunakan unt menyerap air dan mineral
Atriplex (Saltbush), menggunakan trikomanya unt mensekresikan klbhn garam, mncgh akumulasi garam berlebih dlm tanaman
Pada perkembangan daun awal, trikoma yg mengandung polifenol bfgs unt melindungi thd dampak merusak sinar UV B
Pd bbrp sp tumbuhan, adanya trikoma yg rapat dpt dgunakan unt menghindari pemakanan oleh insekta, peletakan telur insekta, dan pengkonsumsian oleh larvaenya

Pengklasifikasian trikoma bdsrkn morfologinya
Papillae, pertumbuhan ke arah luar dr epidermis, kdg dibedakan dr trikoma
Simple trichomes (unbranched), uniseluler atau multiseluler
Root hairs

Sel silika dan sel gabus
Sel silika berasal dr tjdnya deposisi silika dlm jml besar pd sel penyusun bag shoot dr grass, ketika sel tsb tlah bnr2 berkembang mk lumennya akn penuh terisi dg silika. Sel gabus ddnya mengalami suberisasi dan kadang mengandung bhn organik padat

Perkembangan sel silika dan sel gabus
Pasangan sel silika-gabus berasal dr pembelahan simetris atau equal sel inisial di bag basal meristem daun dan internodus, shg tbtk sel anakan yg simetris pula. Sel sebelah atas mrpk calon sel silika sdgkn sel sebelah bawah mrpk cln sel gabus. Sel silika biasanya membesar lbh cepat drpd sel gabus dan tumbuh menonjol dr permukaan epidermis dan menuju sel gabus. Sel silika yg mendekati dewasa, nukleusnya akn pecah dan lumen selnya terisi dg bhn-bhn fibrillar dan mengandung droplet lipid, ke-2 bhn tsb kemungkinan mrpk sisa protoplas. Akhirnya pd sel silika yg menua lumennya terisi dg silika, yg berpolimerisasi mbtk badan silika. Sdgkn sel gabus tetap memiliki nukleus dan sitoplasma saat dewasa

Sel bulliform (Sel Kipas)
Sel yg btknya spt gelembung dijumpai pd semua monokotil, kecuali Helobiae. Dpt dijumpai di kedua sisi daun, tdk terbatas pd epidermis sj tp seringkali ditemukan pd sel yg kurang berwarna bdktn dg mesofil. Kadang dijumpai di seluruh permukaan atas bag helaian, kadang terbatas diantara tulang daun dan membentuk semacam berkas, bag tengah selnya biasanya lbh besar. Fungsinya untuk mengurangi panas. Selnya mengandung air dan tak berwarna. Dinding luarnya lbh tebal drpd sel-sel epidermis yg berada di dktnya, mengalami kutinisasi dan mpy kutikula. Expansion cell, pd bbrp tahap perkembangan daun, sel-sel tsb mengalami ekspansi yg cepat shg diperkirakan berperan thd pembentagan daun. Motor cell, dg adanya perubahan turgor, sel-sel tsb berperan dlm pembukaan higroskopik dan pergerakan menutup dr daun dewasa

Read More

PERTUMBUHAN SEKUNDER BATANG

The Birth New Meristem

Pertumbuhan primer merupakan aktivitas meristem ujung akar dan batang.

Menyebabkan pertumbuhan memanjang kearah atas (SAM) dan ke bawah (RAM)

Pertumbuhan sekunder dipicu oleh meristem selain diujung batang dan akar.

Meristem baru ini terbentuk dari sisa jaringan provascular.

Menyebabkan pertumbuhan ke arah lateral.

Disebut juga sebagai meristem lateral.

Kambium

Meristem lateral di batang adalah kambium.

Umum dijumpai pada tanaman berkayu maupun arborescent (Conifer).

Terbentuk pertama kali dibagian jaringan  pengangkut antara xilem dan floem.

Disebut juga dengan kambium fasikuler

Diferensiasi kambium berlanjut pada daerah diantara berkas pengangkut (interfasikuler region) sehingga dsb kambium interfaskuler.

KAMBIUM VASKULER

Pada tanaman herba dikotil yang hanya dijumpai sedikit pertumbuhan sekunder, Kambium fasikuler merupakan satu-satunya daerah yang aktif.

Pada tanaman herba tidak berkayu tidak dijumpai kambium. Kalaupun ada tidak aktif membelah.

Aktivitas kambium berlangsung terus-menerus pada tanaman perenial

Pada tanaman annual aktivitasnya hanya sementara. Sebelum tanaman mati, kambium menghentikan aktivitasnya dan berdeferensiasi menjadi xylem dan floem.

PERIDERM

Merupakan pembungkus batang tanaman dikotil dan angiosperm.

Terdiri dari felem dan feloderm yang terbentuk dari felogen.

Felogen merupakan meristem sekunder .

Diinisi oleh parenkim kortek terluar, umumnya satu atau dua lapis di bawah epidermis.

FELEM

Felogen ke arah luar membentuk felem.

Felem merupakan sel yang tersusun rapat dengan bentuk seperti sel induknya (felogen).

Sel dewasa merupakan sel mati dan dinding sekunder mengandung suberin yang tinggi.

Impermiabel terhadap air.

Sehingga sel diluarnya akan mati.

FELODERM

Felogen ke arah dalam membentuk feloderm.

Merupakan sel hidup, seperti sel-sel parenkim kortek.

Pada awal perkembangannya, sel-sel tersebut sebagai tempat fotosintesis, memiliki kloroplas dan butir-butir pati.

Lentisel

Periderm yang mengalami spesialisasi untuk pertukaran gas.

Lentisel merupakan daerah yang terbentuk oleh sel-sel yang tersusun longgar yang merupakan turunan dari felogen. 

Read More

Produksi Industrial Asam Amino

•Produksi asam amino adalah perusahaan multi-miliar dolar. Kesemuanya dua puluh asam amino diproduksi, meskipun dalam jumlah yang sangat berbeda.

•Asam amino digunakan sebagai aditif pakan hewan “animal feed additives” (lisin, metionin, treonin), penguat rasa “flavor enhancers” (monosodium glutamat, serin, asam aspartat) dan sebagai nutrisi khusus di bidang medis.
•Asam glutamat, lisin dan metionin adalah asam amino yang paling banyak dijual. Asam glutamat dan lisin dibuat melalui fermentasi; metionin dibuat oleh sintesis kimia. Produsen utama asam amino adalah Jepang, AS, Korea Selatan, Cina dan Eropa.
•Industri asam amino berakar pada praktek persiapan makanan di Jepang. Rumput laut telah digunakan selama berabad-abad di sana dan di negara-negara Asia lainnya sebagai bahan penyedap.

•In1908, Kikunae Ikeda dari Tokyo Imperial University mengisolasi prinsip penguat rasa dari kombu rumput laut (Laminaria japonica) sebagai kristal monosodium glutamat (MSG).

•Menambahkan MSG untuk daging, sayuran dan hampir semua jenis lain dari makanan jadi membuatnya gurih, sifat ini disebut umami.

Read More

RHODOPHYTA

Characteristic of Red Algae

§Multicelluler, only some of them unicelluler.

§Has body called a thallus because it lacks roots, stems, or leaves. Talus berbentuk filamen bercabang-cabang terbuka atau pseudoparenkimatis kompak. 

§Use structures called holdfasts to attach themselves to rocks.

§Pyrenoid present in chloroplast

§They have single nucleus, ring-shaped, haploid or diploid

§Absence of flagella and centrioles

§Have pigments that enable them to use the light that penetrates in to deep water for photosynthesis (may be red, blue, etc) à Phycobilins à pigment for absorbing light

§Marine seaweeds that can live in great depths.

§Smaller than brown algae and live in deeper waters

§Grow in warm saltwater habitats

Pigmen Fotosinstesis

•Pigmen fotosintesis utama berupa klorofil a dan fikobilin.

•Fikobilin bersatu dengan protein membentuk fikobili-protein, yang terdiri dari fikoeritrin, fikosianin dan allofikosianin. Kadang-kadang ditemukan pula klorofil d tetapi fungsinya kurang jelas.

•Pada permukaan luar tilakoid, fikobiliprotein membentuk granula fikobilisom untuk menangkap sinar dan mentransfer energi ke klorofil a yang menyelubungi membran tilakoid. Talus berwarna merah apabila pigmen fikoeritrin dominan.

Cadangan makanan

Cadangan makanan disebut tepung floridea, berupa rangkaian a-1,4-glukosa seperti glikogen atau amilopektin pati, terdapat di luar plastida dalam sitoplasma

Read More

MATERI KULIAH_MONOKOTIL 2

Ordo Scitamineae (Zingiberales)

• Benang sari fertil 1 atau 5 (pada Ravenala madagascariensis 6)
• Bunga biasanya setangkup tunggal.
• Daun tersusun berseling atau spiral, pangkal pelepah terbuka dan jarang tertutup.
• Bakal buah tenggelam.
• Biji mempunyai endosperm.
• Ordo ini terdiri dari 4 familia, yaitu Musaceae, Zingiberaceae, Cannaceae dan Marantaceae

Familia Musaceae

• Always : robust non-aromatic herbs; leaves simple, huge, spiral, rolled up lengthwise in bud, the leaf bases forming a fleshy pseudotrunk; 5 stamens, 1 staminode; ovary inferior, 3-locular.
• Usually/often : flowers mostly unisexual; fruit a many-seeded berry oe fleshy capsule.
• Different from Sterlitziaceae : leaves not in two rows. Different from Zingiberaceae : non aromatic, 5 stamens.
• Distribution and ecology : Distributed widely in tropical regions, some species are cultivated.
• The family only has few genera and approximately 150 species such as Musa (± 80 spp.) and Phenakospermum.

Read More

Materi kuliah_Monokotil

MONOCOTYLEDONEAE (LILIOPSIDA)

nKELAS MONOCOTYLEDONEAE

§Tumbuhan berkayu atau umumnya herba (terna);

§Batang memiliki berkas pengangkut yang tersebar merata dan tidak tersusun dalam silinder tunggal (yakni tidak tampak seperti cincin pada irisan melintang);

§Daun biasanya bertulang sejajar, bagian tepi hampir selalu rata;

§Bunga terdiri dari 3 bagian (trimer) atau kelipatan 3;

§Biji memiliki embryo dengan satu kotiledon.

§Terdapat perkecualian terhadap sifat-sifat ini, tetapi umumnya sulit ditemukan penyimpangan lebih dari satu sifat dan secara umum sifat-sifat tersebut merupakan sifat khas monokotil.

nKLASIFIKASI

§Para ahli taksonomi berbeda pendapat dalam menetapkan klasifikasi Monocotyledoneae.

§Bessey membagi kelompok ini menjadi 8 ordo, Engler dan Diels membaginya menjadi 11 ordo dan 45 familia, sedang Hutchinson membaginya menjadi 26 ordo dan 68 familia.

Read More

Pengantar Mikrobiologi

lApa yang anda pikirkan ketika mendengar kata mikrobiologi?

Organisme sangat kecil dan hanya dapat dilihat dengan mikroskop

Kuman yang dapat menimbulkan penyakit

lBEBERAPA JENIS MIKROBA

Escherichia coli (A)  Cyanobacterium (B) Jamur (C)

Virus Ebola (D)

Parasit protozoa (E)

lCABANG MIKROBIOLOGI
(DASAR)

1.Keanekaragaman (Virologi, Bakteriologi, Mikologi, Protozoologi, Parasitologi)

2.Fisiologi Mikroba

3.Genetika Mikroba

4.Ekologi Mikroba

5.Patogenesis

6.Immunologi

7.Epidemologi

lCABANG MIKROBIOLOGI
(APLIKASI)

1.Mikrobiologi Medis (Kemoterapi)

2.Mikrobiologi Industri (Teknologi Fermentasi)

3.Mikrobiologi Lingkungan (Bioremediasi)

4.Rekayasa Genetika

5.Mikrobiologi Makanan (Biosafety)

lPOSTULAT KOCH

lAgen penyebab khusus harus dijumpai pada setiap kasus penyakit.

lOrganisme penyebab penyakit dapat diisolasi dalam kultur murni.

lInokulasi kultur tersebut ke orang sehat atau hewan harus menghasilkan penyakit yang sama.

lOrganisme penyebab penyakit dapat diisolasi dari orang atau hewan yang terinokulasi dan sama dengan kultur murninya.

Read More

PROSPEK PEMANFAATAN SUMBER-SUMBER BUKTI BARU DALAM PEMECAHAN PERMASALAHAN TAKSONOMI TUMBUHAN

Oleh :Prof. Drs. Suranto,M.Sc. Ph.D


MIKROSKOP
q Peranan mikroskop dalam taksonomi :mengamati bentuk atau ultra struktur butir-butir pollen.

qTipe mikroskop yang digunakan:

  1. Scanning Electron   Microscopy (SEM)

  2. Transmission Electron   Microscopy (TEM)

  3.  Mikroskop cahaya   (konvensional)

qData taksonomi dari morfologi pollen cukup penting karena mengingat organ generatif tumbuhan ini relatif stabil dalam konsistensi penampakan dibandingkan dengan sifat morfologi tumbuhan yang lain.


KIMIA
qKemotaksonomi digunakan dalam taksonomi karena senyawa-senyawa kimia tumbuhan merupakan sifat empirik yang bernilai, serta dapat digunakan untuk menetapkan identitas suatu tumbuhan (Harborne, 1975).


ELEKTROFORESIS
qMerupakan metode yang paling handal dalam memecahkan permasalahan taksonomi (Harborne, 1975) terutama apabila sifat morfologi sulit sekali dibedakan.
qDigunakan untuk menganalisis taksonomi di bawah species


Ranunculus triplodontus
(suranto,1991)
qRanunculus dianalisis dengan 4 macam enzim:
qMengungkap kejelasan posisi species Ranunculus triplodontus yang mempunyai kompleksitas morfologi daun yang terdapat di berbagai kondisi lingkungan yang berbeda tetap merupakan satu species.
qData eksperimen (isozim) dan data morfologi dapat saling mendukung.

GENETIKA
qKromosom digunakan untuk memecahkan masalah yang berhubungan dengan morfologi tumbuhan.
qDiuji menggunakan 4 macam isozim      
qMaka Variasi morfologi R. nanus terbukti terjadinya variasi morfologi daun didasari oleh faktor genetik    


MOLEKUL
qDNA digunakan untuk penggolongan virus tumbuhan khususnya genus Potyvirus strain Sugarcane Mosaic Virus berdasarkan sekuens “gen CP( selubung protein) ” menjadi Johnson Grass Mosaic Virus (JGMV)
qBerdasarkan sekuens DNA “gen selubung protein” strain JGMV yang dulunya 3 strain sekarang dikenal 4 strain (Suranto,dkk. 1998)

Dalam taksonomi modern, semakin banyak data yang digunakan, maka semakin kuat validitas klasifikasi status taksonomi tumbuhan.

  

  1.  Classical Taxonomy

   Pengelompokan tumbuhan berdasar sifat-  sifat makro yang menarik (morfologi).

  2.  Experimental taxonomy

  Pengelompokan tumbuhan yang tidak       hanya berdasarkan sifat morfologi        tetapi juga karakter mikro (kandungan       kimia, jumlah kromosom, data genetik).

 

  Taksonomi tumbuhan berperan penting dalam:

  -  identifikasi

  -  menguji klasifikasi yang   telah dibuat   berdasarkan sifat morfologi

  -  mengetahui hubungan kekerabatan

  -  pengaruh lingkungan (Grant, 1984).

Read More